MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 2784

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018627	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018627	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018627	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018627	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018627	TAT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018627	ATT	3	9	3070	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018627	TGT	2	6	3083	3088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018627	T	6	6	3099	3104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018627	CAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018627	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018627	AATC	2	8	5411	5418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018627	GAAT	2	8	6849	6856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018627	GAA	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018627	ATA	2	6	13424	13429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018627	AAT	2	6	16849	16854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018627	TTA	2	6	16929	16934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018627	AAT	2	6	17007	17012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018627	TAAA	2	8	17023	17030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018627	TTTC	2	8	17680	17687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018627	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018627	TCC	2	6	18547	18552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018627	GTT	2	6	20322	20327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018627	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018627	TTA	2	6	20338	20343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018627	T	6	6	20377	20382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018627	TCT	2	6	20386	20391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018627	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018627	TAA	2	6	21722	21727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018627	T	9	9	21769	21777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018627	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018627	T	6	6	21809	21814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018627	TTC	2	6	23766	23771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018627	T	7	7	23802	23808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018627	A	6	6	23886	23891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018627	AGA	2	6	23901	23906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018627	A	6	6	30339	30344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018627	TTG	2	6	30765	30770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018627	TTTC	2	8	31651	31658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018627	AGG	2	6	31745	31750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018627	T	6	6	31769	31774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018627	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018627	AGA	2	6	31968	31973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018627	CTT	2	6	31983	31988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018627	GCAG	2	8	32007	32014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018627	TCTA	2	8	32055	32062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018627	A	6	6	32364	32369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018627	AATT	2	8	32379	32386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018627	AAT	2	6	32408	32413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018627	TTAA	2	8	32419	32426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018627	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018627	AAG	2	6	33450	33455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018627	A	6	6	33500	33505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018627	TTAA	2	8	33509	33516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018627	TGT	3	9	33523	33531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018627	AGAT	2	8	33552	33559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018627	AAG	2	6	33568	33573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018627	ATTTAA	2	12	33591	33602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018627	TGG	2	6	34225	34230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018627	ATAAA	2	10	34280	34289	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018627	A	6	6	34297	34302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018627	TTC	2	6	37584	37589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018627	TTC	2	6	37625	37630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018627	TGC	2	6	37673	37678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018627	TC	3	6	37735	37740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018627	TCAA	2	8	37774	37781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_018627	AGA	2	6	37863	37868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018627	TCTAG	2	10	37999	38008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018627	TAT	2	6	38098	38103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018627	GAA	2	6	39474	39479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018627	TTA	2	6	42380	42385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018627	GAA	2	6	42402	42407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018627	AGT	2	6	42691	42696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018627	TTTTAA	2	12	42714	42725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018627	CAA	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018627	A	6	6	43431	43436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018627	GTT	2	6	43443	43448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018627	GAC	2	6	44135	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018627	ACG	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018627	GTCG	2	8	44193	44200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018627	GTC	2	6	44211	44216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018627	AAGA	2	8	48048	48055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018627	GAA	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018627	ATAA	2	8	49526	49533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018627	A	6	6	49535	49540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018627	TA	3	6	52209	52214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018627	GAT	2	6	52225	52230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018627	TCG	2	6	52292	52297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018627	TTG	2	6	52307	52312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018627	T	6	6	52323	52328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018627	T	8	8	52358	52365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018627	GTC	2	6	52411	52416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018627	A	6	6	52447	52452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018627	TTTTG	2	10	52482	52491	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018627	AAG	2	6	52511	52516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018627	AAAG	2	8	52606	52613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018627	TTTA	2	8	52616	52623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018627	A	6	6	54474	54479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018627	T	7	7	54499	54505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018627	AAT	2	6	54527	54532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018627	AAAG	2	8	54784	54791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018627	GTT	2	6	57778	57783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018627	TGG	2	6	57858	57863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018627	TTAAT	2	10	57962	57971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018627	GGT	2	6	58087	58092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018627	A	8	8	58096	58103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018627	TCTTT	2	10	59406	59415	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018627	GGC	2	6	59445	59450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018627	GAG	2	6	59504	59509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018627	ATT	2	6	59553	59558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018627	TTA	2	6	59580	59585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018627	A	6	6	59602	59607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018627	TAA	2	6	59654	59659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018627	AGA	2	6	59730	59735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018627	GTTT	2	8	59890	59897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018627	TATG	2	8	59905	59912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018627	CTA	2	6	59969	59974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018627	CAA	2	6	63293	63298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018627	TG	3	6	63302	63307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018627	TTG	2	6	64374	64379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018627	A	7	7	64384	64390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018627	GAA	2	6	64401	64406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018627	TCC	2	6	64486	64491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018627	CTTT	2	8	64564	64571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018627	AAT	2	6	64632	64637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018627	T	7	7	71068	71074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018627	A	7	7	71118	71124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018627	CACTT	2	10	71126	71135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_018627	ATA	2	6	71234	71239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018627	T	6	6	72119	72124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018627	TTA	3	9	74086	74094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018627	ATC	2	6	76083	76088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018627	TCA	2	6	77408	77413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018627	TTC	2	6	77485	77490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018627	TAT	2	6	77517	77522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018627	TAAT	2	8	77657	77664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018627	TATT	2	8	77674	77681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018627	TTAA	2	8	77683	77690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018627	TAAA	2	8	77714	77721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018627	ATTA	2	8	77731	77738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018627	AATTT	2	10	77739	77748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018627	ATTATA	2	12	77753	77764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018627	TAT	2	6	77776	77781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018627	AGA	2	6	80492	80497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018627	TAAA	2	8	80498	80505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018627	AAT	2	6	80588	80593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018627	T	6	6	81799	81804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018627	TTCATG	2	12	83052	83063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_018627	GTA	2	6	83316	83321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018627	TCC	2	6	83343	83348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_018627	TTA	2	6	83422	83427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018627	AAT	2	6	83429	83434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018627	AGT	2	6	83442	83447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018627	AAAG	2	8	83478	83485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_018627	A	8	8	84777	84784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018627	ATC	2	6	84790	84795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018627	CAAG	2	8	84835	84842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_018627	AGAAA	2	10	87351	87360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018627	GTT	2	6	87380	87385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_018627	TTTA	2	8	87391	87398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_018627	T	7	7	87409	87415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_018627	T	7	7	87429	87435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_018627	ATAA	2	8	87446	87453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018627	T	6	6	87459	87464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018627	ATA	2	6	93329	93334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018627	AGA	2	6	93361	93366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018627	T	6	6	93392	93397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_018627	ATC	2	6	93410	93415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_018627	AGA	2	6	93513	93518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_018627	A	6	6	93543	93548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018627	AAG	2	6	93550	93555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018627	TAA	2	6	93557	93562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018627	ATGT	2	8	93628	93635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_018627	AAT	2	6	93636	93641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018627	TTG	2	6	93674	93679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_018627	GTT	2	6	93953	93958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_018627	GA	3	6	98976	98981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_018627	ATA	2	6	99422	99427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_018627	TG	4	8	128423	128430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018627	T	6	6	128437	128442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_018627	TGT	2	6	128534	128539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_018627	ATT	2	6	131697	131702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_018627	CCT	2	6	131704	131709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_018627	T	8	8	133261	133268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_018627	TAT	2	6	133296	133301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_018627	GA	3	6	134356	134361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
287	NC_018627	ACC	2	6	139002	139007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_018627	TGA	2	6	139095	139100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_018627	T	6	6	139219	139224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_018627	A	7	7	139532	139538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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